Maskapai FlyJaya menghentikan rute penerbangan Jember–Jakarta mulai 14 Oktober 2025 karena alasan komersial dan evaluasi permintaan penumpan
Menjelang reaktivasi 17 Agustus, lisensi seluruh personel Bandara Jember kedaluwarsa sehingga harus meminjam tenaga berlisensi dari Bandara